Medycyna naturalna różni się od współczesnej medycyny między innymi tym, że za wszelką cenę stara się ustalić i wyeliminować przyczynę danego schorzenia. Medycyna naukowa, inaczej zwana akademicką skupia się przede wszystkim na niwelowaniu objawów, a nie na przyczynie. Natomiast medycyna naturalna kładzie nacisk przede wszystkim na przyczynę schorzenia.Ten duży nacisk kładziony na przyczynę ma związek z chińską teorią Pięciu Elementów. Medycyna naturalna opiera się między innymi na teorii wzajemnych wpływów między człowiekiem a naturą. Wedle wierzeń ludzkim ciałem rządzą żywioły, do których należą: Drzewo, Ogień, Ziemia, Metal i Woda. Medycyna naturalna mówi, że jeśli wszystkie te siły pozostają w harmonii to cały organizm ludzki działa sprawnie. Z kolei, gdy coś dzieje się z człowiekiem to wynika to z zaburzenia równowagi pomiędzy Yin i Yang. Chińscy specjaliści zanim podejmą jakąkolwiek decyzję odnośnie możliwych sposobów leczenia, najpierw będą dążyć do ustalenia powstania schorzenia. Dlatego też leczenie dobierane jest indywidualnie do sytuacji, w jakiej dany pacjent się znajduje. Poza tym medycyna naturalna łączy w sobie kilka metod terapii, unikając przy tym leków i nie zapomina o odpowiedniej diecie i ćwiczeniach.
